Le flacon laveur sert à empêcher une entrée d'eau dans la fiole à vide lorsque l'on coupe l'eau dans la trompe à eau. Lors d'une filtration sous vide (autre nom de la filtration sur Büchner), le flacon laveur est placé entre la fiole à vide, et la trompe à eau, et est reliée au reste du système par des tuyau à air; la trompe à eau crée un vide dans la verrerie du montage, si on coupe l'eau du robinet sans casser le vide dans le montage (créer une entrée d'air en enlevant un tuyau à air par exemple) de l'eau pénètre dans le montage, le flacon laveur permet de ne pas contaminer le contenu de la fiole à vide. Un flacon laveur sert également de barboteur pour circuit de synthèse de gaz

Se référer à l'article Filtration sous vide pour un schéma du montage et plus d'explications.