Dame Jessica est la concubine et non l’épouse du duc Leto Atréides, et ce pour une raison aussi pragmatique que cynique : tant que le duc Leto 1er n'est pas officiellement marié, nombre de familles - mineures ou majeures - du Landsraad peuvent espérer un mariage politique. Cependant, le duc Leto n’a jamais consenti à une telle éventualité et a toujours considéré Dame Jessica comme la seule et unique femme qui compterait dans sa vie. Elle aurait pu utiliser ses “pouvoirs” pour le convaincre de l’épouser, mais elle l’aimait trop pour lui imposer ce qu'elle considérait comme une trahison.

Si la famille Atréides connait ses origines (elle descendrait selon la légende des rois grecs d'Atrée), la concubine royale Jessica, tout comme bon nombre d’autres soeurs Bene Gesserit, ne connait rien de ses origines, si ce n'est que sa mère était elle-même Bene Gesserit. Elle n'apprend que plus tard (lorsqu'elle et le jeune Paul échappent aux assassins Harkonnen dans le désert) le secret de ses origines par Paul, qui lui annonce de façon relativement brutale : « Depuis ma plus tendre enfance, on m'a appris que les Harkonnens sont nos ennemis, pourtant nous sommes des Harkonnens ! » (sic. passage à relire pour les termes exacts ). En effet, Dame Jessica est une Harkonnen et pas n'importe laquelle : elle est la fille du Baron Vladimir Harkonnen lui-même. Concernant sa mère, il y a deux versions, selon que l’on se fie à Frank Herbert, ou à Brian Herbert son fils. En effet, dans sa trilogie “Avant Dune”, écrite en collaboration avec Kevin J. Anderson, la révérende mère Gaius Helen Mohiam est la mère de Jessica. Cependant, dans Les Enfants de Dune, Jessica apprend le nom de sa mère de la bouche de son petit fils Leto : « Elles (les Bene Gesserit) savent que vous êtes une Harkonnen ! Cela est inscrit dans leurs registres de reproduction : Jessica, née de Tanidia Nerus par le Baron Vladimir Harkonnen. ». Mais Tanidia Nerus peut également être un nom de code pour nommé Gaius Helen Mohiam dans les registres secrets et sacrés du Bene Gesserit… C'est d’ailleurs pour cette raison que son ordre lui a tant reproché de n’en avoir fait qu’à sa tête et d'avoir cédé à ses propres envies lorsqu’elle donna au duc un héritier mâle et non une fille : l’ordre avait prévu que l'union de cette fille avec Feyd-Rautha Harkonnen (le neveu du Baron Vladimir) donnerait naissance au Kwisatz Haderach. Bien que les pouvoirs de Paul Muad'Dib fussent considérables, lui-même comprit qu’il n'était pas ce “court-chemin” (traduction du terme Kwisatz Haderach) qu’attendait le Bene Gesserit.

Après l’épreuve de l’eau de la vie, Jessica devient la révérende mère des fremens et l'enfant conçu avec le duc Leto sur Arrakis nait alors prématurément. Elle s’appelle Alia, qui sera connue sous le nom de Sainte Alia du Couteau, soeur de Paul