C'est Carl Gustav Jung qui l'amène à s'intéresser à l'oeuvre de Freud avec qui il commence une correspondance sur la psychanalyse qui reste extrêmement heuristique aujourd'hui pour l'histoire du mouvement, de son lien à la religion et à la pédagogie. Il a pratiqué comme analyste et été l'un des fondateurs de la Société Suisse de Psychanalyse. Il fut un des premiers praticien de l'analyse profane et a eu de nombreux patients connus comme Henri F. Ellenberger, Emil Oberholzer, etc. Il a entres autres été proche de Hermann Rorschach, Hans Zulliger et de Jean Piaget.

Références

• Sigmund Freud, Correspondance avec le pasteur Pfister, 1909-1939, Gallimard,1991(ISBN 2070722937)
• Michel Baron, Oskar Pfister : pasteur à Zurich, 1873-1956 : psychanalyse et Protestantisme, In Press,2000(ISBN 2951228643)
• Danielle Milhaud-Cappe, Freud et le mouvement de pédagogie psychanalytique 1908-1937; August Aichhorn, Hans Zulliger, Oskar Pfister, Vrin,2007(ISBN 2711619001)