Fils de Thomas Platter le vieux (1499-1582), Thomas Platter le jeune à effectué ses études de médecine à l'Université de Montpellier. Il devint professeur d'anatomie et de botanique en 1624 à l'Université de Bâle et y finit sa carrière en tant que doyen et recteur.

Thomas Platter est l'auteur d'un journal de voyage, sorte de récit d'initiation qui le mena dans le sud et l'ouest de la France, le nord de l'Espagne ainsi que dans les Pays-bas et l'Angleterre. ("Le voyage de Thomas Platter" présenté par Emmanuel Le Roy Ladurie, Fayard, 2000)